本期《袁来如此》為(wèi)系列文(wén)章《大分(fēn)子生物(wù)分(fēn)析概论》的第十三篇,旨在根据已发表的文(wén)献资料,对评估药物(wù)临床前PK/PD时,开发和选择LBA方法的策略作初步介绍。
由于内容篇幅较長(cháng),本文(wén)将采取上下篇形式进行推送,敬请垂注!《袁来如此》专栏系广州博济医药微信公众号打造的科(kē)普學(xué)术专栏,内容均為(wèi)博济医药子公司深圳博瑞副总经理(lǐ)袁智博士原创。
1.导论
药物(wù)发现是一个快速的transformative的过程,其包括靶标识别、靶标验证、先导药物(wù)的识别和优化。随着项目推进经过这些阶段,对生物(wù)分(fēn)析的需求也在相应地改变。开发合适的生物(wù)分(fēn)析方法可(kě)以提供药代动力學(xué)和药效动力學(xué)(PK/PD)的宝贵数据,以支持在新(xīn)药研发项目不同阶段中关键的药效和安全性研究,从而為(wèi)项目的进展奠定坚实的基础。在新(xīn)药早期的发现阶段,会同时考虑不同药物(wù)模式(drug modalities)的多(duō)个分(fēn)子。一般有(yǒu)多(duō)种模式可(kě)供选择,取决于靶标及其位置,例如,传统的小(xiǎo)分(fēn)子、多(duō)肽、单克隆抗體(tǐ)、抗體(tǐ)-药物(wù)偶联物(wù)、纳米抗體(tǐ)、融合蛋白药物(wù)、双特异性生物(wù)药和寡核苷酸。在生物(wù)技术产业中,药物(wù)的快速发现以及快速开发正推动着生物(wù)分(fēn)析领域的发展和演进。这种演进的主要内容是,缩短分(fēn)析运行时间,实施multiplex分(fēn)析,提高灵敏度,降低样品體(tǐ)积的消耗,实现分(fēn)析测试的自动化。
本文(wén)关注的重点是临床前蛋白药物(wù)生物(wù)分(fēn)析方法的开发策略,即LBA分(fēn)析平台的选择和方法开发中的关键注意事项。本系列之前的文(wén)章,基本是关注用(yòng)于临床样本分(fēn)析的LBA方法。為(wèi)了简单起见,在此文(wén)中仅评估用(yòng)于检测蛋白药物(wù)的sandwich format的LBA,而蛋白药物(wù)在大多(duō)数情况下,意味着单克隆抗體(tǐ)。虽然相关技术有(yǒu)多(duō)方面的进步,本文(wén)将重点关注已经商(shāng)业化和在生物(wù)分(fēn)析行业十分(fēn)流行的技术。文(wén)末的参考可(kě)以引导读者非常详细地了解相关内容。
目前最流行的3种技术是ELISA、電(diàn)化學(xué)发光(ECL、MSD、NJ、USA)和Gyrolab®(Gyros Protein Technologies、Uppsala、Sweden)。 同时,本文(wén)会简要地涵盖以下几项不经常使用(yòng)但具有(yǒu)超高灵敏度的技术:如基于Single Molecule Array平台(单分(fēn)子阵列,Simoa™),单分(fēn)子计数[SMC™]的Erenna® 平台(Singulex Inc、CA、USA),免疫聚合酶链反应平台(immuno-polymerase chain reaction、immuno-PCR、 Imperacer®、Chimera Biotec GmbH、Dortmund、Germany)。另外,还会简要介绍multiplexing的Luminex平台(Luminex xMAPR、Luminex Corporation、TX、USA)。在药物(wù)发现阶段,分(fēn)析方法开发是生物(wù)分(fēn)析的主要内容之一,同时,应当特别考虑评估耐受性(tolerance)和分(fēn)子完整性(molecular integrity)。
2.临床前LBA方法的关键参数
用(yòng)于药物(wù)发现阶段的生物(wù)分(fēn)析方法有(yǒu)5个重要参数:样品體(tǐ)积要求,定量的动态范围,测试运行时间,灵敏度和自动化程度。本文(wén)将简要地评估这些参数,并介绍这些参数在选择检测平台时发挥的重要作用(yòng)。
1) 样本體(tǐ)积消耗
从小(xiǎo)鼠身上单次采集的血清或血浆样本的體(tǐ)积约為(wèi)50ml。随着在动物(wù)研究中尝试实施3R(替换replacement,减少reduction 和细化refinement ),生物(wù)分(fēn)析业界正在探索多(duō)种微體(tǐ)积采样方法,而这将进一步大幅度地减少样本體(tǐ)积。另外,在分(fēn)析小(xiǎo)鼠脑脊液等基质的样本时,只有(yǒu)2-5ml的體(tǐ)积可(kě)用(yòng)。考虑到有(yǒu)可(kě)能(néng)意外损失样本,故从动物(wù)获得的样本體(tǐ)积应足以分(fēn)析样本至少两次。因此,应当首选能(néng)够使用(yòng)低样本體(tǐ)积的分(fēn)析技术和平台。
2) 定量动态范围
能(néng)够在宽广的动态范围内,至少包含3-4个数量级,进行定量分(fēn)析是极其有(yǒu)益的。对于PK分(fēn)析,这允许较高的最小(xiǎo)稀释要求(minimum required dilution,MRD),以尽量减少样本基质效应,同时為(wèi)低剂量给药的样本提供所需的定量灵敏度。同样,对于PD,它允许在更宽广的范围内测试平行性(parallelism),从而允许对含有(yǒu)高浓度生物(wù)标志(zhì)物(wù)的样品进行大幅度的稀释。对于生物(wù)标志(zhì)物(wù)测量,稀释还有(yǒu)助于最大限度地减少样本和基于缓冲液的标准曲線(xiàn)(替代基质)之间的基质差异,从而更精确地生成定量数据。
3) 分(fēn)析运行时间
分(fēn)析运行时间是实施PK/PD样本分(fēn)析所需时间,假定使用(yòng)之前已為(wèi)该应用(yòng)开发分(fēn)析方法,这也意味着假定试剂已标记,缓冲液已制备,并且相关仪器也已准备就绪。在non-GLP临床前生物(wù)分(fēn)析实验室中,时间是至关重要的;在大多(duō)数情况下,最终目标是提供可(kě)靠,且可(kě)以重现的数据,同时保持较短的分(fēn)析运行时间。这就提高了实验室的效率,并允许该部门同时支持多(duō)个项目。分(fēn)析96样本微孔板的运行时间可(kě)以在1-5小(xiǎo)时的范围之间,具體(tǐ)取决于采用(yòng)的分(fēn)析技术(对于某些分(fēn)析技术,有(yǒu)额外的隔夜捕获步骤overnight capture step)。
4) 灵敏度
大多(duō)数传统的单克隆抗體(tǐ)的PK定量LLOQ在几个ng/ml范围。一些高效力药物(wù)分(fēn)子(需要低剂量)和低丰度(或下调了的)的生物(wù)标志(zhì)物(wù)可(kě)能(néng)需要更高的灵敏度。应当依据个案的情况為(wèi)这些应用(yòng)选择相应的分(fēn)析平台。此外,高灵敏度的分(fēn)析方法是高度依赖所使用(yòng)的试剂,因此获得高特异性和高亲和力的试剂可(kě)以大大提高定量的灵敏度。提升分(fēn)析灵敏度也同时降低了对样本體(tǐ)积的要求,见1)。
5) 自动化
自动化平台可(kě)缩短分(fēn)析人员操作的时间,提高生物(wù)分(fēn)析部门的效率。在临床前药物(wù)开发的环境中,分(fēn)析平台的完全自动化,在需要开发分(fēn)析方法且进行常规样本分(fēn)析的情况下是非常有(yǒu)益的。同时,对于方法开发,优化和因基质或物(wù)种变化而进行的方法认证,需要能(néng)够修改自动化平台上的检测方法的灵活性。
除了分(fēn)析测试自动化之外,还可(kě)以自动化地制备标准品(standards)和质量控制样品(QCs),从而节省时间,降低珍贵参照(比)物(wù)料(reference material)的使用(yòng)和成本,并减少手动移液产生的误差。一些分(fēn)析测试平台,如Gyrolab,允许检测的全自动化,而Hamilton和HPD300这样的平台,则可(kě)以允许自动化移液體(tǐ),或制备标准品和QCs。超高灵敏度的Simoa™平台也支持自动化地样本检测。
3.临床前LBA免疫测试平台
目前,有(yǒu)多(duō)种LBA测试平台在新(xīn)药开发中得到应用(yòng)。表1列出了若干LBA测试平台及其比较。本文(wén)将进一步介绍其中几种在生物(wù)分(fēn)析行业中应用(yòng)比较广泛的平台。由于為(wèi)临床前研究开发分(fēn)析方法所选择的LBA平台,很(hěn)可(kě)能(néng)会继续在临床研究中继续使用(yòng),因此,选择合适的测试平台,将会是影响深遠(yuǎn)的一个重大决定。
表1. 若干LBA测试平台相关特征的比较
备注:上表中的方法未全部在文(wén)中详细介绍。
近年来,一系列immunoassay的新(xīn)技术,特别是基于微(磁)珠(beads,magnetic,etc.)的技术,从测试格式的物(wù)理(lǐ)學(xué)/物(wù)理(lǐ)化學(xué)层次,待测物(wù)的捕获,检测信号的收集/放大,数据处理(lǐ)等方面,实现了显著改善,并取得了相当的商(shāng)业性成功,虽然这些新(xīn)方法在化學(xué)和生物(wù)學(xué)层次,仍然是基于抗體(tǐ)-抗原的结合作用(yòng)以及基本的夹心式immunoassay。本文(wén)选择若干得到广泛商(shāng)业应用(yòng)的测试平台,及其在临床前生物(wù)分(fēn)析方法开发的应用(yòng)作初步介绍,希望起到抛砖引玉的目的,引发更多(duō)关于新(xīn)的分(fēn)析测试技术的开发和应用(yòng)的相关讨论、交流和研究。
ELISA平台
ELISA是生物(wù)制药行业内外使用(yòng)最广泛的配體(tǐ)结合式(LBA)检测平台。ELISA的测试格式包括直接式、间接式和夹心式;ELISA经常用(yòng)作与开发中的新(xīn)分(fēn)析平台进行比较的基础;在96孔板上,通常对样本进行复孔(duplicate)测定,手动或半自动运行。通常使用(yòng)比色法的检测试剂,但有(yǒu)时也使用(yòng)其他(tā)检测试剂,如发光(luminescence)和荧光(fluorescence)。通常,对ELISA方法,需要监测试剂,如抗體(tǐ)(antibodies)、配體(tǐ)(ligands)、缓冲液(buffers)以及批次的变化。
几十年来,传统的ELISA一直是蛋白质定量分(fēn)析最常用(yòng)的技术,因此也是最可(kě)靠的技术之一。即使在今天,大多(duō)数生物(wù)标志(zhì)物(wù)的商(shāng)业检测试剂盒都是基于ELISA的。多(duō)数新(xīn)分(fēn)析技术都与作為(wèi)金标准的ELISA比较。但是,这种分(fēn)析技术也有(yǒu)缺点,例如,测试运行时间约長(cháng)為(wèi) 4-5 小(xiǎo)时,样品體(tǐ)积消耗大(测定體(tǐ)积為(wèi)100 ml),灵敏度低与LLOQ在大多(duō)数情况下接近低-中ng/ml,以及狭窄定量动态范围(2-3 数量级)。这项技术对于某些临床前生物(wù)分(fēn)析的应用(yòng)仍然很(hěn)有(yǒu)吸引力,比如血清单克隆抗體(tǐ)的PK。该平台还提供了在方法开发早期阶段评估测试方法不同部分(fēn)的灵活性。表2列出了不同检测平台的性能(néng),以一个mAb药物(wù)為(wèi)例。
表2. 与ELISA比色法检测相比较,一个mAb在若干检测平台上LBA方法参数的比较
备注:上表中的方法未全部在文(wén)中详细介绍。
電(diàn)化學(xué)发光(Electrochemiluminescence,MSD)平台
MSD平台是一种基于微孔板的测试格式,它利用(yòng)電(diàn)化學(xué)发光(ECL)信号进行检测。在这个平台上,免疫测试格式类似于用(yòng)于药物(wù)定量和target sample measurements的典型ELISA格式,但预计灵敏度会因使用(yòng)化學(xué)发光而增加。MSD平台似乎主要在检测信号的产生和收集上,相对于ELISA有(yǒu)显著改善:MSD采用(yòng)SULFO-TAG(三联吡啶钌)是一种发光底物(wù),其分(fēn)子量约為(wèi)1000Da(大约是HRP的1/40),因此空间位阻小(xiǎo),易于标记抗體(tǐ),且不易妨碍其与待测物(wù)或其它抗體(tǐ)的结合。SULFO-TAG在阳极表面失去電(diàn)子,发生氧化,在三丙胺阳离子自由基的催化及三角形脉冲電(diàn)压激发下,可(kě)产生高效、稳定、连续的電(diàn)化學(xué)发光信号,使得检测信号增强并稳定(见图1)。
图1. MSD的電(diàn)化學(xué)发光产生的检测信号
MSD的電(diàn)化學(xué)发光技术在生物(wù)分(fēn)析行业广受欢迎。它保持了ELISA格式的优点,如方法开发的灵活性,另外在其它领域也非常出色,如较小(xiǎo)的样品體(tǐ)积要求(测定體(tǐ)积為(wèi)25–30 ml),更高的灵敏度(低-中pg/ml)和宽泛的动态范围(4-5个数量级)。当以均相的测试格式运行时,此平台可(kě)能(néng)受到钩效应(hook effect)的影响。钩效应起源于不合适的抗體(tǐ)-抗原浓度比例,但是可(kě)以减轻甚至消除的。此外,试剂和微孔板容易有(yǒu)批次间的变化,因此,强烈建议在批次之间进行交叉比较。
MSD微孔板的孔底為(wèi)石墨底,捕获抗體(tǐ)包被载量可(kě)提升10-50倍,检测范围比ELISA扩展了10-100倍,定量动态范围高达5-6个数量级,灵敏度可(kě)提升10-1000倍(fg/ml-pg/ml级别)。根据对血清免疫學(xué)中的“带现象”的理(lǐ)解,可(kě)推测:包被抗體(tǐ)载量可(kě)以根据检测灵敏度的需要进行调整,以避免钩效应(hook effect)。分(fēn)析运行时间接近约3-4小(xiǎo)时,但考虑到该平台提供的其它优势,测试时间可(kě)被视為(wèi)一个合理(lǐ)的折中。该平台允许同时运行多(duō)个96孔板,因此在分(fēn)析数百个样品时,测试一个或多(duō)个96孔板也只需要基本相同的时间,这一点可(kě)能(néng)非常有(yǒu)利。此平台不是自动化的,因為(wèi)它需要分(fēn)析人员参与每个步骤。此外,该平台还提供与实验室信息管理(lǐ)系统(LIMS)的集成和US FDA 21 CFR part 11的合规性,允许分(fēn)析方法结果容易地转移到GLP的环境中。
Gyrolab平台
Gyrolab是一个非96微孔板的免疫测试平台,具有(yǒu)液體(tǐ)处理(lǐ)功能(néng)(liquid handling capability),使用(yòng)小(xiǎo)體(tǐ)积的样本和试剂在光盘(CD)上实施免疫测定。该测试格式使用(yòng)biotinylated捕获试剂和标记有(yǒu)fluorophore的检测试剂,在纳升體(tǐ)积的使用(yòng)亲和力微珠填料的捕获柱(nanoliter volume affinity capture column)上进行测试。利用(yòng)CD的微观结构确定样品和试剂的體(tǐ)积,并通过旋转CD将样本加到捕获柱上。在每个CD上,有(yǒu)96(在1000nlCD上)-112(在20或200nl CD上)个微观结构,可(kě)产生96-112个数据点(1小(xiǎo)时/CD运行时间)。在Gyrolab工作站上,样品处理(lǐ)完全自动化,液體(tǐ)处理(lǐ)臂将样品和试剂从微孔板转移到CD,并通过激光/检测器测定每个捕获柱的荧光信号。基础的Gyrolab xPlore™ 允许无人值守地一次分(fēn)析1张CD,而Gyrolab xPand™允许分(fēn)析多(duō)达5张CD(即480-560个数据点)。在大多(duō)数情况下,动态范围為(wèi)3-4个数量级。该平台的灵敏度可(kě)与MSD的ECL平台(低-中pg/ml)相媲美。
Gyrolab是一个自动化的微流體(tǐ)系统(microfluidic system),且其离心操作能(néng)够高效地处理(lǐ)微量體(tǐ)积,因此大多(duō)数重复(duplicate)分(fēn)析只需要小(xiǎo)于5ml的样本體(tǐ)积,就可(kě)以从同一微孔板重新(xīn)分(fēn)析未使用(yòng)的样品。该平台使用(yòng)包被了捕获抗體(tǐ)的微珠来捕获待测物(wù),与下面讨论的Luminex和Simoa平台在捕获待测物(wù)的原理(lǐ)上,即在更大的固相表面积上有(yǒu)更多(duō)的捕获抗體(tǐ)(与ELISA相比),似乎有(yǒu)异曲同工之妙,总體(tǐ)效果是提升了捕获待测物(wù)的效率,提升了灵敏度。Gyrolab的一个出色特点是,可(kě)以选择不同的CD来调整定量的动态范围,以满足对低或高浓度样本的分(fēn)析。该分(fēn)析技术平台对于大分(fēn)子的常规临床前PK/PD分(fēn)析无疑是非常有(yǒu)效的。此平台在缩短检测时间方面非常有(yǒu)效,无需人工移液和参与分(fēn)析的每一步骤。这使得该平台对开发方法和分(fēn)析样本都极具吸引力。此外,该平台还提供实验室信息管理(lǐ)系统集成和FDA 21 CFR part 11合规性,能(néng)够将分(fēn)析方法轻松地转移到GLP环境中去。
Gyros的一个可(kě)能(néng)缺点是,如果以基于微孔板格式开发了分(fēn)析方法检测,则相同的试剂在转移到Gyros时可(kě)能(néng)会性能(néng)欠佳,并且可(kě)能(néng)需要显著地优化才能(néng)获得最佳性能(néng)。这是因為(wèi)Gyros的孵育时间极短,需要高结合效率的捕获试剂,而基于微孔板的检测则不需要这种试剂,因為(wèi)较長(cháng)的孵育时间抵消了该需求。因此,如果使用(yòng)Gyros,则需要在同一平台对试剂进行筛选,然后测试其分(fēn)析性能(néng),并开发完整的分(fēn)析方法。
BIAcore平台
基于BIAcore平台的药物(wù)分(fēn)析,依赖于待测物(wù)与固定在传感器芯片(sensor chip surface)表面的待测物(wù)特异的试剂的相互作用(yòng)。BIAcore实时监测该结合相互作用(yòng),并读出以相对响应单元(relative response units,RU)為(wèi)单位的响应,该响应与Surface Plasmon Resonance(SPR)角度的变化相关,并且由传感器芯片表面的液體(tǐ)薄膜的折射率变化所决定。折射率的变化与芯片表面结合的质量成正比。这种实时的无标记技术与典型的免疫测定法有(yǒu)很(hěn)大的不同,免疫测定法需要多(duō)个孵育和洗涤步骤,以及用(yòng)于信号读出的标记检测抗體(tǐ)(labeled detection antibody)。对于临床前药物(wù)分(fēn)析,可(kě)以将抗药物(wù)特异性抗體(tǐ)固定在芯片表面实施通用(yòng)化检测,当样本流经分(fēn)析隔室(cell)时,该抗體(tǐ)将结合样本中所含有(yǒu)的mAb药物(wù)。其它方式,如在芯片上固定待测物(wù),也可(kě)用(yòng)于特定的定量分(fēn)析。对于此平台,在验证期间必须经过10个周期的残留(carry-over)测试,并且还应确定最大信号值(相对于背景值)的信号噪声比(signal-to-noise ratio),以评估样本分(fēn)析期间的方法运行性能(néng)。此外,还必须评估在执行大批量样本分(fēn)析的较長(cháng)时期内的芯片稳定性(分(fēn)析方法是特定于所使用(yòng)的芯片类型)。由于该平台通常运行一夜或更長(cháng)时间,故样本和试剂的稳定性必须比典型的免疫测试方法具有(yǒu)更長(cháng)的短期稳定性(超过24小(xiǎo)时),而且在Biacore T200上,样本的总通量(overall sample throughput)较低。此外,单个分(fēn)析运行需要包含校准曲線(xiàn)后和运行序列中间隔的QC样本。通常,这对应于一个微孔板的校准品(calibration standards,Cs)和样本。
可(kě)以对BIAcore实施IQ/OQ/PQ验证,以满足符合21 CFR Part 11的要求。使BIAcore仪器达到GLP合规的状态不是一个简单的过程,需要投入大量时间来处理(lǐ)数据传输(data transfer)和合适的校准(随时间推移的)等问题。
该测试平台更多(duō)地用(yòng)于LBA关键试剂的筛选和表征。LBA关键试剂一般定义為(wèi):对待测物(wù)(analyte)特异性的LBA分(fēn)析试剂,如抗體(tǐ)、多(duō)肽、蛋白质、耦合物(wù)(标记),作為(wèi)试剂的药物(wù)和ADA试剂(阳性和阴性对照品)。
多(duō)通道(multiplexing)分(fēn)析技术
Multiplexing测试方法可(kě)以节省时间和宝贵的样品。但是,存在一个局限:即它们经过严格优化,只能(néng)在指定范围和基质中使用(yòng)。不同的待测物(wù)对不同的基质和稀释的反应不同,因此,对于某个待测物(wù),优化参数的偏差可(kě)能(néng)需要重新(xīn)优化整个multiplexing检测方法。在临床前生物(wù)分(fēn)析中,需要探索了解多(duō)种药物(wù)、多(duō)个药物(wù)变异體(tǐ)、多(duō)种药物(wù)的组合和多(duō)种生物(wù)标志(zhì)物(wù)。因此,检测的灵活性是非常关键的,对此multiplexing可(kě)能(néng)帮助意义不是很(hěn)大。
在样本體(tǐ)积十分(fēn)有(yǒu)限的特殊情况下,可(kě)以探索multiplexing。允许自主开发multiplexing方法的平台包括:Luminex的xMAP技术,使用(yòng)独特的dyed beads,并取决于所使用(yòng)的仪器(MAGPIX、LUMINEX 200或FLEXMAP 3D),可(kě)以分(fēn)析50-500待测物(wù);Quanterix SR-X,使用(yòng)6个独特的磁珠,可(kě)以multiplexing多(duō)达6个待测物(wù);Quanterix SP-X可(kě)以multiplexing到10个待测物(wù),使用(yòng)其基于平面阵列的空间分(fēn)离的化學(xué)发光成像技术。其中,MSD允许从黄金标准的singleplex平台直接转换到U-PLEX平台进行检测;Quanterix的SR-X和SP-X平台在multiplexing时能(néng)够提供超高灵敏度。
Luminex平台
常用(yòng)的Luminex®100/200™系统是基于流式细胞學(xué)(flow cytometry)原理(lǐ)的灵活程度很(hěn)高的分(fēn)析仪。该系统使用(yòng)很(hěn)小(xiǎo)的样本體(tǐ)积,在单个微孔板的孔/井中multiplex(同时测定)多(duō)达100个待测物(wù)。该平台可(kě)以操作许多(duō)检测格式,包括核酸测试方法(nucleic acid assays)、受體(tǐ)-配體(tǐ)测试方法(receptor-ligand assays)、免疫测试方法(immunoassays)和酶测试方法(enzymatic assays),并提供快速且经济高效的生物(wù)测试结果。
该系统是xMAP® 3个核心检测技术的组合。第1个是xMAP微球,这是一个荧光染色,微米大小(xiǎo)的聚苯乙烯微球系列,既作為(wèi)标识符,又(yòu)充当建立测试方法的固體(tǐ)表面。第2个是基于流式细胞學(xué)的仪器(flow cytometry-based instrument),Luminex 100/200分(fēn)析仪集成了关键的xMAP检测组件,如激光、光學(xué)器件、流體(tǐ)技术和高速数字信号处理(lǐ)器。第3个组件是xPONENT®软件,它专门设计為(wèi)基于方案(protocol-based)的数据采集方式,具有(yǒu)强大的数据回归分(fēn)析的能(néng)力。
Luminex利用(yòng)特定染料的珠子(beads),该珠子包被有(yǒu)特定的抗待测物(wù)抗體(tǐ)。添加待测物(wù)孵育后,再添加荧光标记的抗體(tǐ),以检测和定量待测物(wù)。此项技术使用(yòng)供应商(shāng)预先生产的试剂盒,主要用(yòng)于PD检测,即生物(wù)标志(zhì)物(wù)的定量分(fēn)析,并且采用(yòng)多(duō)通路检测(multiplexing)的方式。商(shāng)业化的试剂盒数量巨大,据称达1,300余种。一个样本可(kě)以用(yòng)于测定多(duō)个待测物(wù),据称最多(duō)可(kě)达500个,并且可(kě)以对每种待测物(wù)设置接受标准。不足之处是:不同待测物(wù)珠子(analyte beads)有(yǒu)交互干扰(cross-talk)的倾向,而且测试方法对光敏感,因此必须采取特殊的预防措施。
超高灵敏的定量分(fēn)析技术
对于某些药物(wù)和样本基质,可(kě)能(néng)需要具有(yǒu)fg/ml-低pg/ml的超高灵敏度的定量分(fēn)析方法。相关状况包括定量低丰度的生物(wù)标志(zhì)物(wù),对强效药物(wù)分(fēn)子的PK分(fēn)析和定量极易受到基质效应影响的待测物(wù),显然,大幅度稀释样本会提升对测定平台灵敏度和定量动态范围的要求。
目前,允许自主开发方法的超高灵敏度的定量分(fēn)析平台包括来自Quanterix,基于Simoa™的数字化ELISA,来自Singulex的使用(yòng)单分(fēn)子计数(single molecule counting)的Erenna™,以及来自Chimera Biotec GmbH的基于免疫PCR(immuno-PCR)的Imperacer。
之前已经发表的文(wén)章详细评估了这3种超高灵敏度的分(fēn)析技术,以及其它不太流行的分(fēn)析技术。这3种技术都是需要供应商(shāng)提供检测方法的分(fēn)析仪器,但都允许用(yòng)户自主开发检测方法。当拥有(yǒu)实时定量PCR(qPCR)仪器(thermal cycler fitted with a fluorimeter)时,还可(kě)以独立于供应商(shāng)提供的试剂或仪器开发Immuno-PCR方法。在使用(yòng)这些技术时,需要特别注意一些非常规情况,包括Simoa™ 的磁珠偶合,DNA与检测试剂的偶合,以及无污染地操作immuno-PCR。
基于单分(fēn)子阵列(Simoa™)的数字化ELISA
来自Quanterix公司的Simoa™数字化ELISA是一个很(hěn)有(yǒu)前途的平台,它可(kě)以使蛋白质定量达到fg/ml。该技术采用(yòng)基于微观顺磁珠(microscopic paramagnetic bead)的免疫测试方法,并结合独特的信号检测和数据采集系统。数字化ELISA分(fēn)2个阶段实施。在捕获抗原的第1阶段,涂有(yǒu)捕获试剂的微观磁珠与样品混合,然后加入生物(wù)素标记的检测抗體(tǐ)(biotinlabeled detection antibody)和链球菌素-β-半乳糖酶(streptavidin–b-galactosidase)。然后,这些珠子被加载到光盘上,光盘上装有(yǒu)一系列體(tǐ)积為(wèi)飞升(femtoliter)大小(xiǎo)的微井阵列。每个微井的直径為(wèi)4.5mm,能(néng)够容纳直径為(wèi)2.7mm的珠子数目只能(néng)為(wèi)1或者為(wèi)0。被硅胶垫片密封的微井含有(yǒu)荧光底物(wù),其用(yòng)于信号生成和放大(图2)。Simoa™ 技术在定量分(fēn)析的第二阶段采用(yòng)了独特的信号检测系统。微井(50飞升)中浓度相对较高的发出荧光的产物(wù)(阳性事件)和白光散射(white light scattering)测定的总珠子负载可(kě)以由标准的CCD摄像机轻松地检测到和记录。通过改进几个检测步骤,Simoa™ 实现了超高灵敏度。
图2. 在飞升體(tǐ)积(femtoliter)的井阵列中装载,密封和成像单个顺磁珠
因為(wèi)在100mL的反应體(tǐ)积中有(yǒu)约200,000个磁珠,而每个磁珠捕获约80,000个抗體(tǐ)分(fēn)子,抗體(tǐ)-待测蛋白的比值和平衡允许高效地在给定的示例中,>70%捕获待测物(wù)。由于溶液中有(yǒu)这么多(duō)的磁珠,而且可(kě)以在溶液中运动,所以捕获效率进一步提高,因為(wèi)每个目标蛋白在不到1分(fēn)钟时间内就会遇到磁珠。这与传统的LBA方法中,固定在一个表面的捕获抗體(tǐ)与待测物(wù)的缓慢结合完全相反。另外,优化了的biotin-labeled detection antibody与streptavidin–b-galactosidase之间的比值,可(kě)减少检测背景并最大化特定信号的采集。与Simoa™检测系统相结合,相关荧光信号可(kě)以通过荧光底物(wù)(fluorogenic substrate)的酶消化(enzymatic digestion),而进一步放大。
Simoa™ 检测系统能(néng)够检测到单个结合事件(a single binding event),该事件可(kě)以在低浓度下以数字方式获得(灵敏度增高,数字化ELISA),或在高浓度模式下以模拟的方式获得(扩展了的定量动态范围)。荧光用(yòng)于检测酶活性,并能(néng)够测定每个磁珠上酶的平均值。与下面描述的Erenna®平台一样,结合数字式和模拟式的读数功能(néng),可(kě)以实现非常宽广的定量动态范围。由于最终信号采集是在平面阵列上完成标准成像,因此与使用(yòng) Erenna®等流體(tǐ)系统的数值读出相比,数据采集更快。
尽管Erenna® 和Simoa™ 平台具有(yǒu)数字读出和宽广的定量动态范围等共同点,但Simoa™ 平台是一个完全自动化的系统,该仪器可(kě)以实施样品稀释(高达1:10稀释),混合,洗涤,孵化和数据采集步骤。Simoa™ 能(néng)够同时测定多(duō)达10种不同的待测物(wù)(multiplexing)。这是通过对单个捕获抗體(tǐ)使用(yòng)不同的dye linkers来实现的。之后,对阵列进行多(duō)个波長(cháng)的荧光成像,以识别拥有(yǒu)不同dye linkers的亚组,并确定是否存在enzyme reporter标记。与Singulex和Quanterix一样,有(yǒu)许多(duō)试剂盒可(kě)供选择。也可(kě)以“定制”开发,或“自主开发”分(fēn)析方法。
凭借较高的灵敏度、multiplexing和自动化功能(néng),该平台看起来非常理(lǐ)想。Simoa™平台与LIMS系统兼容,其软件满足监管级别的生物(wù)分(fēn)析据FDA 21 CFR part 11的合规性要求。筆(bǐ)者认為(wèi)该平台因其超高灵敏度(可(kě)以使用(yòng)微量样本體(tǐ)积)和自动化操作,在相当的程度上可(kě)以替代Gyrolab平台,用(yòng)于临床前PK样本分(fēn)析。
Singulex Erenna®平台
Erenna®免疫测试系统利用(yòng)两步的过程实现超高灵敏度定量分(fēn)析(ultrasensitive assays)。最初,使用(yòng)biotinylated capture试剂和荧光标记检测试剂,在96孔板中实施基于珠子(beads)的夹心式测试格式。从珠子上洗脱的被捕获待测物(wù)被转移到一个384孔的读取板(reading plate),然后将该读取板放置到检测仪器上。然后样本一个接一个地通过毛细管进入flow cell,并在其中实施激光诱导的单分(fēn)子检测分(fēn)析。该平台的优势是宽广的定量动态范围,其通过独特的软件曲線(xiàn)拟合算法实现。该算法利用(yòng)了多(duō)次读数,提升了灵敏度。
与其它测试平台相比,检测时间较長(cháng),但一些線(xiàn)下的自动化设备可(kě)用(yòng)于洗涤和转移步骤。该平台通常用(yòng)于PD检测,但也可(kě)用(yòng)于PK定量分(fēn)析。对供应商(shāng)生产和供应的试剂盒,其稳定性必须由最终用(yòng)户评估,因為(wèi)试剂的稳定性通常是未知的。此外,可(kě)以購(gòu)买通用(yòng)试剂,以开发内部的检测试剂,而且,基于微孔板的格式也能(néng)兼容使用(yòng)96或384孔板的平台。供应商(shāng)建议对校准品(Cs)进行3次复测(triplicate),以便在低浓度下进行精确分(fēn)析。可(kě)以通过IQ/OQ程序,与内部PQ相结合,验证Erenna®平台。如果将Erenna®与LIMS结合,以实施监管级生物(wù)分(fēn)析,则一个选择是使用(yòng)读出的三个信号之一进行浓度分(fēn)析。但是,动态范围和灵敏度可(kě)能(néng)会受到影响,具體(tǐ)取决于选择哪个读出的信号。
Immuno-PCR (Polymerase Chain Reaction)
Immuno-PCR(Chimera)是一种扩增免疫测试技术(signal amplification immunoassay)。它涉及DNA标记的检测抗體(tǐ)的扩增,从而提高灵敏度。与ELISA中使用(yòng)的抗體(tǐ)-酶偶合物(wù)(antibody–enzyme conjugates)不同,IPCR中的关键试剂是抗體(tǐ)-DNA偶合物(wù)(antibody–DNA conjugates),其中一个DNA标记(marker)与检测抗體(tǐ)相偶合。然后,将DNA polymerase加入到反应主混合物(wù)之中,就可(kě)以放大检测信号,并通过定量PCR(qPCR)而定量测定DNA-marker的浓度,从而定量分(fēn)析analyte–antibody immunocomplex。因此,该技术主要改进了检测信号的放大方法。但是,如果检测抗體(tǐ)与血清或血浆中的成分(fēn)发生交叉反应,该平台可(kě)能(néng)容易受到强大基质效应的影响。因此,在方法验证期间必须评估信噪比,并用(yòng)于确定样本分(fēn)析期间方法的性能(néng)。
该平台的优点包括宽广的定量动态范围和提升了的灵敏度,这对PD分(fēn)析是很(hěn)有(yǒu)益的。与 Erenna®平台一样,检测试剂高度依赖于供应商(shāng),对于大批量样本分(fēn)析来说,成本可(kě)能(néng)很(hěn)高。如同MSD、Erenna®和其它基于珠子的平台一样,应特别注意标记试剂和微孔板批次的变化。由于该平台依赖于PCR技术,因此在处理(lǐ)样本、试剂和移液器枪头时必须小(xiǎo)心谨慎,以避免污染。此外,数据分(fēn)析可(kě)能(néng)也会较為(wèi)麻烦(cumbersome)。
7. 特别声明
本文(wén)如有(yǒu)疏漏和误读相关指南和数据的地方,请读者评论和指正。所有(yǒu)引用(yòng)的原始信息和资料均来自已经发表學(xué)术期刊, 官方网络报道等公开渠道, 不涉及任何保密信息。 参考文(wén)献的选择考虑到多(duō)样化但也不可(kě)能(néng)完备。欢迎读者提供有(yǒu)价值的文(wén)献及其评估。
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